从美国回到国内，进入中K院计算技术研究所工作；1990年被选聘为国家智能计算机研究开发中心主任。
在“曙光一号”的研发过程中，李光杰主导了全新的技术路线和科研模式，为了提高曙光超级计算机的产品化和商品化，他大胆开辟了新的路径。
在超级计算机硬件方面，李光杰在国内首次采用大规模集成电路来研制并行超级计算机；在超级计算机系统方面，他让团队在UNIx源代码的基础上，研发了超级计算机操作系统SNIx。
在科研模式上，李光杰派了一支6人小队到硅谷，利用国外协作配套完善的大环境，加速“曙光一号”超级计算机的研制。
1993年10月，“曙光一号”超级计算机诞生，峰值运算速度达每秒6.4亿次，在多个技术上取得突破，采用全对称共享存储多处理结构、操作系统核心实现并行化。
1995年李光杰被遴选为工程院院士，同年创立了中K院曙光信息产业有限公司，生产曙光系列超级计算机，担任董事长兼总经理。
“老李应该知道，孙健去年10月投资10亿元，在中官村高新园区成立国智电脑公司时，一口气购买了500亩工业用地，肯定就有了进军超级计算机的念头，老倪的加入成了一个进入的契机！孙健每进入一个行业，就会发生一次大地震，成立国智超级计算机研究所和生产基地，对国内超级计算机的研发和生产具有重要的促进作用，孙健是奔着top500第一名而去的，不仅为国争光，还会对国内互联网产业和人工智能产业的快速发展产生积极的影响，科技部和中K院都会积极支持。老李，中科曙光公司的那些年轻人想离开，就成全他们，强扭的瓜不甜，只要他们进入国智超级计算机研究所，同样是为国内超级计算机的研发贡献力量，我们也没有什么好遗憾的，我们再招聘人才。”
路院长也在第一时间看见了国智超级计算机研究所在pN上发布的高薪招聘广告，孙健又是大手笔！心里高兴，国内超级计算机产业的发展将会加速，也预感对银河系列超级计算机和曙光系列超级计算机的研发造成不利影响，研发人员流失不可避免，但对国内超级计算机的研发和生产是一件大好事。
“路院长，我也对孙健大手笔进军超级计算机产业感到高兴，只要孙健持续投入，国智超级计算机赶超日立、富士通、Ibm和Intel研发的超级计算机只是时间问题。”
李光定虽然有些郁闷，但他知道国内超级计算机产业同日本和美国还有巨大的差距，银河系列超级计算机和曙光系列超级计算机如今装配的都是Intel生产的cpU和英伟达生产的GpU，容易受制于人！但国智超级计算机系列可以采用国智半导体公司生产的cpU和GpU，使用鲲鹏软件集团研发的操作系统，完全具有自主知识产权，在超级计算机安全风险方面可控。