造成了自己的私人武装，各级军官既是他的部属，也是他在教团中的门生弟子，只对他一人效忠。
盖茨将军反感伊萨克·胡克纵容邪教腐蚀军队思想，更厌恶此人不可一世的军阀做派，还曾公开宣称：
“伊萨克·胡克好比寄生在我军体内的一颗毒瘤，必须尽早清除这个祸害！”
话都说到这个份上了，双方势同水火也就不令人意外了。
此番盖茨将军率部南下驰援王子港，顶着“巴登大捷”英雄的光环荣归故里，可谓来势汹汹，履任之初就与死对头胡克将军展开激烈的权力斗争。
盖茨将军奉行的原则是“攘外必先安内”，认为在与来自北方的强敌正式开战之前，最要紧的就是排除掉己方阵营内部的隐患。
在他看来，伊萨克·胡克就是最大的隐患！
盖茨将军宣布对王子港进行军管，解散议会，就是要强行夺取胡克的地盘，剪除他的羽翼。
接下来，盖茨将军还打算给胡克将军来一招“明升暗降”，踢到冷衙门去养老，剥夺他的指挥权，接管他麾下的骑兵师，把具有邪教背景的军官通通摘出来，彻底打散这支部队，整编到自己带来的大陆军南方兵团当中。
按照盖茨将军的计划，完成整编改造之后的王子港驻防部队，肃清邪教流毒，焕然一新，由胡克的私人武装转变成为一支忠于大陆会议和他本人的革命军队，将会在抵抗斐真大军入侵的战斗中发挥关键作用。
事后来看，盖茨将军整顿王子港驻军的初衷是好的，可惜选错了时机，同时也太低估了他的对手伊萨克·胡克。
胡克将军在王子港苦心经营多年，在当地的势力可谓根深蒂固，背后还有本地士绅乡贤和征服教团力挺，当然不肯乖乖交出手中的军权，任由查尔斯·盖茨摆布。
就算盖茨将军顶着“巴登大捷”的英雄光环莅临王子港，也很难如同事先设想的那般进行大刀阔斧的整顿，推行的新政受到重重阻碍，与胡克阵营的矛盾也越来越尖锐，双方的内斗愈演愈烈。
眼瞅着温斯洛普兵团已经在弯刀海岸登陆了，大敌当前，己方两位将军不思团结御敌，反而争权夺利，内斗不休，大陆会议的代表们实在看不下去了，索性把胡克兵团调往城外的豪斯镇驻防，名义上是与王子港的盖茨兵团互为犄角，协防南下敌军，其实就是想把两派人马分隔开，避免双方矛盾激化。
大陆会议的决定，令盖茨将军深感不满，认为这是毫无原则的妥协，致使他整顿胡克兵团、清除邪教流毒的计划功亏一篑。
另一方面，胡克将军也对大陆会议的这一决定愤愤不平，认为这是在公然偏袒盖茨，打压王子港的本土势力。
自己身为王子港驻防司令，却被逐出老巢，丢了苦心经营的地盘，被迫栖身于穷乡僻壤的小镇，无疑受到了莫大的羞辱，岂能咽得下这口气！